La advocación de la iglesia nos deja bien a las claras un origen alto medieval de esta arruinada parroquia situada en el extremo sur de Villavicencio, ya fuese en el mismo emplazamiento que ocupa en la actualidad o por traslado desde algún punto cercano.

Los restos se muestran al pie de una de las más paradigmáticas torres de estilo mudéjar del amplio territorio que se extiende entre las provincias actuales de León, Palencia y Valladolid, la conocida como “Faro de Campos”. Su origen se halla en una construcción anterior forrada con paramentos de ladrillo que actualmente le dan un particular aspecto de absoluta robustez.

Característica extendida en el amplio catálogo de torres, que como esta se yerguen en la comarca de Tierra de Campos, es el de las filas de ventanas en sus cuerpos superiores, 48 en el caso de San Pelayo, que tuvo que tener 52 si seguimos el dicho popular que decía aquello de… “si quieres conocer cuantas semanas tiene el año, cuenta los ventanajos de San Pelayo”

Mantenía hasta las primeras décadas del siglo XX una iglesia con amplia y esbelta cabecera de piedra y 3 naves estructuradas a partir de pilares cruciformes con cimentación pétrea. Las imágenes conservadas permiten observar su curioso pórtico situado en el acceso al norte de la edificación, más cercano a la población y un cementerio al sur.